Bonjour,
votre question est tout à fait pertinente.
En général, la médecine alternative utilise plutôt les parties de plantes séchées, appelées aussi "drogues". Il est aussi possible d'utiliser des parties fraîches de plantes, mais sachez que les effets seront parfois différents et parfois il se peut que la plante fraîche donne des effets secondaires.
Ainsi, il est préférable de suivre le livre de phytothérapie que vous lisez.
Sinon, voici des compléments d'informations, concernant l'utilisation du thym
http://www.creapharma.fr/N210/thym.html
Meilleures salutations
vnguyen