Il faut savoir qu'en cas de cystite pour un traitement à base d'homéopathie c'est surtout les symptômes qui vont définir le remède (donc très individualisé), et non la maladie en elle-même.

Voici néanmoins des remèdes homéopathiques très utilisés lors de cystite : 
- Cantharis, par ex. à la dilution 9CH (Cantharis 9CH).
Posologie : 3 granules à laisser fondre sous la langue, à jeûn au besoin (3 à 4 fois par jour).

- Lors de cystite chronique Sepia officinalis 200K peut être indiqué.
Posologie: prendre 1 dose unique le premier jour puis reprendre une autre dose unique une semaine après

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